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《福建师范大学学报（自然科学版）》是福建师范大学主办的面向国内外公开发行的综合性自然科学学术理论刊物，设有数学、计算机科学、物理学、化学、生命科学、地理科学、环境科学、运动学等栏目。
《福建师范大学学报（自然科学版）》创办于1956年，原刊名为《福建师范学院学报》，不定期出版；“文革”期间停刊， 1975年复刊，刊名为《福建师大学报（自然科学版）》，半年刊；1985年刊名变更为《福建师范大学学报（自然科学版）》，改半年刊为季刊，并使用卷号； 2007年起改为双月刊。
自复刊以来，丁汉波、林辰、林忠民、朱鹤健、吴松刚、李敏等知名专家学者先后担任过本刊的主编和副主编，目前由黄汉升任编委会主任，李敏、林敏任编委会副主任，林敏任主编。
半个多世纪的办刊历程，经几代人的努力，本刊的社会影响日益扩大，刊物质量不断提升。近年发表的论文大部分为国家和省部级各类基金支持的成果，反映了学校的科研水平，收到良好的社会效益。本刊是“综合性科学技术类核心期刊”，入编《中文核心期刊要目总览》；RCCSE中国核心学术期刊；中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）。本刊还是多家国内外权威检索刊物和数据库的收录刊源，主要有：美国（剑桥科学文摘》（CSA），美国《化学文摘》（CA），德国《数学文摘》（ZM），联合国《水科学和渔业文摘》（ASFA），中国学术期刊综合评价数据库，中国期刊网，中国学术期刊（光盘版），万方数据—中国数字化期刊群，中国核心期刊（遴选）数据库，中文科技期刊数据库，中国科技论文在线，中国数学文摘，中国物理文摘，中国光学与应用光学文摘，中国化学化工文摘，中国生物学文摘，中国农业文摘，中国地理与资源文摘等。
本刊取得的成绩同时得到了学报界及上级主管部门的肯定，在历次评比中均取得良好成绩：先后荣获“福建省高校自然科学学报编辑质量评比一等奖”（福建省高校学报研究会，1989年），“全国高校自然科学学报编辑质量评比二等奖”（中国高等学校自然科学学报研究会，1989年），“福建省首届优秀科技期刊评比三等奖”（福建省科委、福建省科协、福建省新闻出版局，1992年），“全国优秀科技期刊评比三等奖”（国家科委、中共中央宣传部、国家新闻出版署，1992年），“福建省高等学校自然科学学报系统优秀学报评比一等奖”（福建省教委办，1995年）”，“全国高等学校自然科学学报系统优秀学报评比一等奖”（国家教委科技司，1995年），“福建省第二届优秀科技期刊评比二等奖”(福建省科委,福建省新闻出版局,1996) ，“福建省高校自然科学学报系统优秀学报评比一等奖”（福建省教委，1999年），“全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊评比二等奖”（国家教育部，1999年），“全国高校优秀科技期刊评比二等奖”（教育部科学技术司，2004）；“首届中国高校优秀科技期刊奖”（教育部科学技术司，2006）；“首届福建省高校精品学报奖”（福建省教育厅，2006）；“中国高校优秀科技期刊”；“华东地区优秀期刊”等。此外，编辑部还荣获“高校科技期刊先进集体”称号（中国高等学校自然科学学报研究会，2005），多位编辑荣获全国和省的“优秀学报主编”，“优秀学报编辑”，“优秀学报工作者”，“优秀编辑”等荣誉称号。
我校学报是福建省创办较早的高校学报之一，在高校学报界已有一定的地位和影响。1984年福建省高校学报研究会成立，我校学报是发起单位之一；华东区高校自然科学学报编辑协会成立，我校自然版学报即当选为理事单位。目前我校学报为华东区高校自然科学学报编辑协会理事，福建省期刊协会理事，福建省科技期刊编辑学会理事，福建省高校学报研究会常务理事。
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